Fold change에 따른 DEG 분석(Python)

바이오마커 표현형(phenotype)의 표지/원인이 되는 유전자 질병의 진단, 치료 등에 활용 차별적 발현 유전자(DEG, Differentially Expressed Genes) RNA 데이터에서 차별적 발현 유전자(DEG) 검출 분석 과발현 : 실험군(e.g. 폐암환자군)에서 이상적으로 양이 많이 발현 되어 있는 유전자 저발현 : 실험군(e.g. 폐암환자군)에서 이상적으로 양이 적게 발현 되어 있는 유전자 차별적 발현 유전자는 꼭 바이오마커라고는 볼 수 없지만 바이오마커의 후보라고 볼 수 있음 DEG를 찾아내는 3가지 방법 Fold Change(계산이 단순, 간단하게 분석하고 싶을 때, 옛날에 많이 썼음, 학술적이지 않다는 의견) P-value(Statistics, 통계학적 접근) Machine Le..